Detalhe da pesquisa
1.
Rhometa: Population recombination rate estimation from metagenomic read datasets.
PLoS Genet;
19(3): e1010683, 2023 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36972309
2.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods;
19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35396482
3.
Xanthomonas rydalmerensis sp. nov., a non-pathogenic member of Group 1 Xanthomonas.
Int J Syst Evol Microbiol;
74(3)2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38536071
4.
qc3C: Reference-free quality control for Hi-C sequencing data.
PLoS Comput Biol;
17(10): e1008839, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34634030
5.
Human milk oligosaccharide profiles and allergic disease up to 18 years.
J Allergy Clin Immunol;
147(3): 1041-1048, 2021 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32650022
6.
BEAGLE 3: Improved Performance, Scaling, and Usability for a High-Performance Computing Library for Statistical Phylogenetics.
Syst Biol;
68(6): 1052-1061, 2019 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31034053
7.
Identification of a novel lineage of plasmids within phylogenetically diverse subclades of IncHI2-ST1 plasmids.
Plasmid;
102: 56-61, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30885788
8.
Online Bayesian Phylogenetic Inference: Theoretical Foundations via Sequential Monte Carlo.
Syst Biol;
67(3): 503-517, 2018 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29244177
9.
Effective Online Bayesian Phylogenetics via Sequential Monte Carlo with Guided Proposals.
Syst Biol;
67(3): 490-502, 2018 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29186587
10.
Analysis of Theileria orientalis draft genome sequences reveals potential species-level divergence of the Ikeda, Chitose and Buffeli genotypes.
BMC Genomics;
19(1): 298, 2018 Apr 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29703152
11.
The impact of migratory flyways on the spread of avian influenza virus in North America.
BMC Evol Biol;
17(1): 118, 2017 05 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28545432
12.
Alignathon: a competitive assessment of whole-genome alignment methods.
Genome Res;
24(12): 2077-89, 2014 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25273068
13.
Phylogenetically driven sequencing of extremely halophilic archaea reveals strategies for static and dynamic osmo-response.
PLoS Genet;
10(11): e1004784, 2014 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25393412
14.
A5-miseq: an updated pipeline to assemble microbial genomes from Illumina MiSeq data.
Bioinformatics;
31(4): 587-9, 2015 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25338718
15.
Comparative genomic analysis of toxin-negative strains of Clostridium difficile from humans and animals with symptoms of gastrointestinal disease.
BMC Microbiol;
16: 41, 2016 Mar 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-26971047
16.
Comparative genomic analysis of a multiple antimicrobial resistant enterotoxigenic E. coli O157 lineage from Australian pigs.
BMC Genomics;
16: 165, 2015 Mar 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-25888127
17.
Progressive genome-wide introgression in agricultural Campylobacter coli.
Mol Ecol;
22(4): 1051-64, 2013 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23279096
18.
Evaluation of recombination detection methods for viral sequencing.
Virus Evol;
9(2): vead066, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38131005
19.
Expanding the range of the respiratory infectome in Australian feedlot cattle with and without respiratory disease using metatranscriptomics.
Microbiome;
11(1): 158, 2023 07 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37491320
20.
Impact of homologous and non-homologous recombination in the genomic evolution of Escherichia coli.
BMC Genomics;
13: 256, 2012 Jun 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-22712577